Ученые из Научно-исследовательского института VIB, Левенского университета и Левинской университетской больницы изучили тысячи здоровых и раковых клеток легких, чтобы создать первый полный атлас опухолевых клеток легких. Они выделили 52 разных типа клеток. Результаты их работы могут быть использованы для идентификации новых исследовательских линий для лечения.
Хотя ученые добились больших успехов в борьбе с раком, научное понимание опухолей на клеточном уровне достаточно ограничено. Появление новых технологий (например, секвенирования одиночных клеток, биоинформатических конвейеров для анализа большого количества генетических данных) позволяет исследовать одиночные клетки в их микросредах с высоким разрешением и получить более глубокое понимание их фенотипов.
Опухоли оказались сложнее, чем предполагалось
Исследователи использовали новую технологию РНК-секвенирования для изучения практически 100 000 одиночных клеток, сфокусировавшись как на раковых, так и не на раковых клетках в опухолях. Они исследовали клетки кровеносных сосудов, иммунные и фиброзные клетки, чтобы создать первый атлас клеточных фенотипов, обнаруженных в опухолях легких.
«Мы были удивлены, обнаружив, что в опухолях существует гораздо больше типов клеток, чем ожидалось. Мы идентифицировали 52 разных клеточных типа» - сообщили ученые.
Изучение клеток в естественной среде
Многие опухолевые клетки никогда не изучались в родной среде. Теперь ученые проанализировали и сравнили клетки опухоли и клетки легких, найденные вне опухоли, и смогли наблюдать, как опухоль их меняет.
«Полный атлас опухолевых клеток, который мы разработали, является эталоном для типов клеток, которые до этого момента изучались исключительно в лабораторных условиях или на живых моделях. Теперь, впервые, мы можем увидеть, насколько эти модели отражают реальную клиническую ситуацию» - сообщили ученые.
Ученые также продемонстрировали, что наличие некоторых типов клеток связано с более низкой выживаемостью пациентов. Это подчеркивает клиническую значимость полученных результатов.
Информация, которую собрали исследователи, будет использоваться для разработки новых стратегий борьбы с образованием кровеносных сосудов в опухолях и тестирования потенциальных целей иммунотерапии.
Результаты исследования вскоре появятся в журнале «Nature Medicine».
Источник: https://medicalxpress.com/news/2018-07-scientists-atlas-lung-tumor-cells.html
