Генетические ошибки вызывают рак. Пропущенные гены, а также структурные изменения – более масштабные перестройки ДНК, которые могут охватывать большие куски хромосом, нарушают тщательно сбалансированные механизмы для регулирования роста клеток. Гены, которые обычно выключены, активируются, и образуются мутированные белки. Эти и другие нарушения, которые заставляют клетки расти без ограничений, приводят к множеству проблем, включая развитие рака.
Для получения информации о том , как проводят лечение рака в Израиле в Асаф Харофе лучшие специалисты страны, и для составления индивидуального плана лечения онкологии в Израиле, оставьте заявку и наш консультант свяжется с Вами в ближайшее время.
На этой неделе ученые лаборатории Cold Spring Harbor опубликовали в журнале Genome Research одну из самых подробных карт структурных изменений генома раковых клеток. На карте показано около 20 000 структурных изменений.
Команда специалистов по секвенированию прочитала геномы раковых клеток. Эта технология читает гораздо более длинные сегменты ДНК, чем старые технологии. Когда результаты интерпретируют с помощью программного обеспечения, преимущества метода очевидны: длительное чтение последовательности ДНК дает больше информации.
Команда продемонстрировала эффективность технологии, используя ее для чтения геномов клеток, полученных из клеточной линии SK-BR-3, важной модели для клеток рака молочной железы с вариациями в гене под названием HER2 (иногда также называемом ERBB2). Около 20% рака молочной железы являются HER2-положительным, что означает перепроизводство белка HER2. Эти раковые заболевания, как правило, являются одними из самых агрессивных.
«Большинство из 20 000 вариантов, которые мы идентифицировали в этой клеточной линии, были упущены при использовании метода короткого чтения, - говорит Мария Наттестад, исследователь. - Мы обнаружили очень сложный набор вариаций ДНК, окружающих HER2».
В своем анализе команда объединила результаты долгожданного секвенирования с результатами другого рода экспериментов, которые читают сообщения или транскрипты, которые генерируются активированными генами. Эта более полная картина привела к необычайно подробному описанию того, как структурные изменения разрушают геном в раковых клетках и проливают свет на то, как быстро развиваются раковые клетки.
По мнению исследователей, необходимо продолжать создавать каталог вариантов типов раковых клеток с использованием последних технологий. Это бесценный инструмент для учета сложности структурных изменений, поэтому ученые надеются, что он будет широко применяться в исследовательской и клинической практике.
Источник: https://medicalxpress.com/news/2018-07-massive-genome-havoc-breast-cancer.html
