Команда исследователей из США, Дании, Польши, Нидерландов и Швейцарии разработала новый способ тестирования на рак - просмотрев размер фрагментов опухолевых ДНК, циркулирующих в кровотоке. В своей статье, опубликованной в журнале Science Translational Medicine, группа описывает свою методику и то, как хорошо она работала при тестировании на пациентах с различными видами рака. Эллен Гейтцер и Майкл Спейхер, с медицинским университетом Граца, предлагают фокусную часть работы, проделанной командой в том же выпуске журнала.
Как отмечает Гейтцер и Шпейчер, в человеческой крови содержится много мелких фрагментов ДНК, большинство из которых - белые лейкоциты. Но бывают случаи, когда вводятся другие типы, например ДНК от плода в крови беременных женщин или фрагменты ДНК, которые вырываются из раковых опухолей. В этой новой работе исследователи обнаружили, что ДНК из опухолей может быть дифференцирована от других типов ДНК в крови по размеру - такие фрагменты имеют тенденцию быть меньше, чем фрагменты ДНК из других источников.
Чтобы воспользоваться этим открытием, исследователи тщательно изучили фрагменты ДНК в крови от нескольких видов рака и обнаружили, что их можно классифицировать по размеру. Затем они создали новую метрику измерения для них на основе размера. Они назвали его обрезанным средним абсолютным отклонением от нейтральности числа копий (t-MAD). Затем группа проверила свой подход, введя фрагменты ДНК в образец крови, а затем сосредоточились на фрагментах ДНК, которым они присвоили рейтинг t-MAD. Довольные своими выводами, они дополнительно протестировали свой подход, проведя аналогичные тесты с кровью от реальных больных раком.
Исследователи сообщают, что их тестирование показало, что этот метод является очень надежным - он дал положительные результаты для 94 процентов рака молочной железы, кишечника, яичника, кожи и желчных протоков с ложной положительной скоростью всего 2,5 процента. Он также оказался на 65 процентов точным при обнаружении рака поджелудочной железы, почек и мозга.
Хейцер и Шпейхер отмечают, что есть еще некоторые вопросы, касающиеся техники. Главным среди них является то, будет ли тестирование столь же точным при использовании в большой многоцентровой клинической обстановке.
Источник: https://medicalxpress.com/news/2018-11-cancer-blood-based-dna-fragment.html
